ارزیابی توالی نوکلئوتیدی و پروتئینی آنزیمهای سیتوکرمP450 در قارچ بیمارگر حشرات Beauveria bassiana
الموضوعات :
1 - گروه تنوع زیستی، پژوهشکده علوم محیطی، پژوهشگاه علوم، تکنولوژی پیشرفته و علوم محیطی، دانشگاه تحصیلات تکمیلی صنعتی و فناوری پیشرفته،
2 -
الکلمات المفتاحية: gene, Motif, ژن, ناحیة حفاظت شده, Cytochrome P450, واژههای کلیدی: روابط فیلوژنتیکی, سیتوکرمP450, Keywords: Phylogenetic relationships,
ملخص المقالة :
توالی نوکلئوتیدی و پروتئینی و روابط فیلوژنتیکی بین ژن های کد کنندة هفت آنزیم سیتوکرمP450 متعلق به قارچ بیمارگر حشرات Beauveria bassiana جدایة ATCC90517 موجود در بانک ژن مورد ارزیابی قرار گرفت. براساس نتایج BLASTN، بیشترین میزان شباهت هفت توالی مورد بررسی با ژن های B. bassiana جدایة ARSEF (84-100درصد) و سپس قارچ های Cordyceps militaris و Isaria fumosorosea (76-89 درصد) مشاهده شد که مطابق نتایج BLASTP بود. محاسبة میزان درصد شباهت توالی ها با یکدیگر با استفاده از برنامه SIAS نشان داد که تنها توالی اسیدآمینه پروتئین های مربوط به دو ژن CYP52X1 وCYP52G11 بالای 47 درصد شباهت نشان دادند که در یک خانواده (CYP52) قرار گرفتند توالی های مرتبط با خانوادههای مختلف شباهت کمتر از 44 درصد داشتند. درخت های فیلوژنتیکی رسم شده با استفاده از نرمافزار IQ-tree v.1.6بر مبنای نوکلئوتید و اسید آمینه نشان دادند که CYP53A26 و CYP617N1 با بیشترین میزان شباهت به یکدیگر در یک گروه جداگانه قرار گرفتند. سایر ژن های P450 نیز با هم در یک گروه بودند. تعیین ویژگی های پروتئینی و نواحی حفاظت شده در هفت آنزیم سیتوکرم P450 در قارچ B. bassiana به دلیل نقش آن ها در اتصال به آهن بسیار مهم و ضروری است. حضور اسید آمینه های متنوع با خصوصیات مختلف در نواحی حفاظت شده توانسته دامنة میزبانی این قارچ را در کنترل حشرات آفت افزایش دهد.
_||_