فراوانی ژن هایcas سیستمCRISPR/Cas در سویههای اشریشیا کلی تولید کننده ESBL، جداشده از عفونتهای دستگاه ادراری
محورهای موضوعی : باکتری شناسی
ندا مریخی
1
(گروه میکروب شناسی، دانشکده علوم زیستی، دانشگاه آزاد اسلامی، واحد تهران شمال، تهران، ایران)
جمیله نوروزی
2
(گروه میکروب شناسی، دانشکده علوم زیستی، دانشگاه آزاد اسلامی، واحد تهران شمال، تهران، ایران)
علی ناظمی
3
(گروه زیست شناسی، دانشگاه آزاد اسلامی، تنکابن، ایران)
مهرداد هاشمی
4
(گروه ژنتیک، دانشکده علوم و فناوریهای پیشرفته، دانشگاه آزاد اسلامی، واحد علوم پزشکی تهران، تهران، ایران)
رباب رفیعی طباطبایی
5
(گروه میکروب شناسی، دانشکده علوم زیستی، دانشگاه آزاد اسلامی، واحد تهران شمال، تهران، ایران)
کلید واژه: اشریشیا کلی, ESBL, عفونت دستگاه ادراری, سیستمCRISPR/Cas,
چکیده مقاله :
سابقه و هدف: سیستم CRISPR (تکرارهای پالیندرومیک کوتاه فاصله دار منظم خوشه ای) و پروتین های Cas، بخشی از سیستم ایمنی میکروارگانیسم ها می باشد. ژنهای cas می توانند در کاهش مقاومت آنتی بیوتیکی باکتری ها مشارکت کنند. هدف از این مطالعه ارزیابی فراوانی ژن های cas سیستم CRISPR/Cas در سویه های اشریشیا کلی تولید کننده آنزیم های بتالاکتاماز وسیع الطیف (ESBLs)، جدا شده از بیماران مبتلا به عفونت های دستگاه ادراری می باشد. مواد و روش ها: در این مطالعه مقطعی، 437 نمونه کشت ادرار، از بیمارستان های چالوس جمع آوری شد. جداسازی سویه های اشریشیا کلی، براساس تست های بیوشیمیایی استاندارد و کیت تشخیص تجاری انتروباکتریاسه آ و همچنین حساسیت آنتی بیوتیکی با استفاده از روش انتشار دیسک (کربی بائر) انجام شدند. آزمون دیسک ترکیبی(CDT) نیز برای جدایه هایی که در آزمون قبلی حداقل در برابر یکی از سفالوسپورین های نسل سوم مقاوم بودند، انجام شد. شناسایی مولکولی ژن های cas1، cas2،cas3،cas7 و cas5 با استفاده از روش واکنش زنجیره ای پلی مراز انجام شد. یافته ها: از میان 437 نمونه کشت ادرار 106 نمونه (24/3 درصد) مبتلا به عفونت اشریشیا کلی بودند. بیشترین مقاومت آنتی بیوتیکی مرتبط با آمپیسیلین (99 درصد) بود. در میان جدایه های مقاوم، 30 جدایه (88/3 درصد) تولید کننده ESBL بودند. ژنcas1 بیشترین فراوانی (96/2 درصد) را داشت و دیگر ژن های cas تقریباً فراوانی یکسانی داشتند. نتیجه گیری: نتایج مطالعه حاضر نشان داد که درصد قابل توجهی از جدایه های اشریشیا کلی دارای فنوتیپ ESBL بودند که می تواند دلیل بر حضور ژن های بتالاکتاماز وسیع الطیف در این نمونه ها باشد. همچنین، نشان داده شد که رابطه ای بین حضور فنوتیپESBL و توزیع ژن های cas وجود ندارد.
Background & Objectives: CRISPR system (clustered regularly interspaced short palindromic repeats) and Cas portions is a part of the immune system in microorganisms. The cas genes could be involved in reducing antibiotic resistance in bacteria. The aim of the study was to investigate the frequency of cas genes of the CRISPR/Cas system in Extended Spectrum Beta-Lactamase (ESBL) producing Escherichia coli isolated from urine culture of patients with urinary tract infection. Materials & Methods: In this cross-sectional study, 437 positive urine culture samples were collected from Chalus hospitals. Escherichia coli strains were isolated based on standard biochemical tests and Enterobacteriaceae commercial diagnostic kit, as well as antibiotic sensitivity using disc diffusion method (Kerby Baer). Combined disk test was conducted for isolates that were resistant to at least one of the third-generation cephalosporins in the foregoing antibiotic susceptibility test. Molecular identification of cas1,cas2,cas3,cas7 and cas5 genes was performed using the PCR method. Results: Out of 437 urin culture samples, 106 samples (24.3%) had E.coli infection. The highest antibiotic resistance was associated with ampicillin (99%). Among the resistant isolates, thirty isolates (88.3%) were ESBL producing. cas1 gene had the highest frequency (96.2%) and other cas genes had almost the same frequency. Conclusion: The results of the present study showed that a significant percentage of E. coli isolates had ESBL phenotype, which may be due to the presence of broad-spectrum beta-lactamase genes in these samples. Besides, it was shown that there is no relationship between the presence of ESBL phenotype and the distribution of cas genes.
_||_