سابقه و هدف: بیماری شانکر عمیق پوستی که توسط باکتری برنریا رابری‌فاشینس ایجاد می‌گردد، از بیماری‌هایی است که باعث کاهش کمیت و کیفیت گردو می‌شود. این مطالعه با هدف شناسایی باکتری شانکر عمیق پوستی بر اساس ویژگی های ریخت شناسی، بیماری‌زایی و استفاده از آغازگرهای اختصاصی ژن‌های مداخله کننده در تولید رنگدانه رابری‌فاشینس انجام گردید. مواد و روش ها: این پژوهش به‌صورت مقطعی- توصیفی بر روی درختان گردو دارای علایم شانکر در استان لرستان انجام شد. پس از خالص‌سازی، شناسایی باکتری ها بر مبنای ویژگی های فنوتیپی جدایه‌ها انجام شد. به‌منظور بررسی دقیق‌تر و ردیابی مستقیم عامل شانکر از آغازگرهای 2BrIF/2BrIR و GSP2F/GSP2R استفاده گردید. همچنین ویژگی های بیماری‌زایی باکتری بر روی نهال و میوه گردو مورد ارزیابی قرار گرفت. یافته‌ها: بر اساس ویژگی های فنوتیپی 14 جدایه به‌عنوان باکتری برنریا رابری‌فاشینس شناسایی شد. این جدایه‌ها در آزمون PCR قطعه مورد نظر 671 و 280 جفت بازی را تکثیر کردند. در آزمون بیماری‌زایی علایم به‌صورت لهیدگی و سیاه شدن بافت در محل تلقیح مشاهده شد. دو جدایه در آنالیز فیلوژنی سطح تشابه 97 و 98 درصدی با دیگر جدایه‌های شناسایی شده در بانک ژنی داشتند. نتیجه‌گیری: آزمون PCR و استفاده از آغازگر‌های اختصاصی یک روش سریع، کاربردی و بسیار حساس در شناسایی باکتری برنریا رابری‌فاشینس نسبت به سایر روش‌های تشخیصی می‌باشد. با توجه به بررسی توان بیماری‌زایی جدایه‌ها در این پژوهش و بروز علایم روی نهال، بیمارگر در شرایط مساعد بیماری خسارت شدیدی به درختان وارد می‌کند. Manuscript profile

سابقه و هدف: بیماری شانکر پوستی گردو توسط باکتری برنریا نیگری فلوئنس ایجاد می گردد. این بیماری در سال‌های اخیر افزایش داشته است و در شرایط مناسب تهدید جدی برای درختان گردو محسوب می‌شود. این مطالعه با هدف جداسازی و شناسایی مولکولی باکتری شانکر پوستی گردو در استان لرستان و بررسی بیماری‌زایی باکتری روی میوه نارس گردو انجام شد. مواد و روش ها: این پژوهش به‌صورت مقطعی-توصیفی بر روی تنه و شاخه های 105 درخت گردو دارای علایم شانکر پوستی در استان لرستان انجام شد. پس از خالص سازی و جداسازی، خصوصیات فنوتیپی جدایه ها مورد بررسی قرار گرفت. سپس نتایج این خصوصیات توسط نرم‌افزار Ntsys-pc version 2.02 آنالیز شد. به منظور شناسایی دقیق تر سویه باکتریایی، از روش واکنش زنجیره ای پلی مراز استفاده گردید. همچنین 5 جدایه باکتری به عنوان نماینده انتخاب و بیماری‌زایی آن‎ها بر روی میوه نارس و نهال گردو بررسی شد. یافته‌ها: بر اساس خصوصیات فنوتیپی جدایه‎ها به عنوان برنریا نیگری فلوئنس تشخیص داده شدند. همچنین آنالیز عددی خصوصیات فنوتیپی در سطح تشابه 94 درصد، جدایه‌ها را به چهار گروه تقسیم نمود. در واکنش PCR، قطعه 255 جفت بازی در تمامی جدایه ها تکثیر گردید. در آزمون بیماری‌زایی، علایم به ‌صورت نقاط سیاه‌ رنگ همراه با ترشح شیرابه روی میوه ظاهر شدند. نتیجه گیری: آزمون‌های فنوتیپی افتراقی، آزمون بیماری‌زایی بر روی میوه نارس گردو و استفاده از آغازگرهای اختصاصی، سریع‎ترین و مطمئن‎ترین روش برای تشخیص عامل بیماری است. مطالعه حاضر اولین گزارش وقوع این بیماری در استان لرستان و از اثبات بیماری‌زایی باکتری برنریا نیگری فلوئنس روی میوه گردو در ایران می‎باشد. Manuscript profile