چکیده مقاومت هلیکوباکترپیلوری نسبت به آنتی بیوتیک‌های رایج علت اصلی پایین بودن درصدریشه‌کنی این باکتری درکشورهای درحال توسعه می‌باشد.به همین دلیل نیاز به یک داروی جایگزین برای درمان عفونت هلیکوباکترپیلوری وجود دارد.داروی جدید باید موثر،کم عارضه ،همراه با اثرات خوب برعلیه هلیکوباکترپیلوری بوده ودرضمن موجب مقاومت باکتری نسبت به دارو نگردد.استفاده از گیاهان دارویی یکی از راه های حل معضل مقاومت میکروبی به شمار می آید.زیرا ترکیبات ثانویه گیاهان مولکول‌های پیچیده ای هستند که تعدادزیادی از آن‌ها دارای فعالیت های بیولوژیک می‌باشند.توجه محققان به ترکیب های موثر گیاهی ،به عنوان راه حلی برای معضل مقاومت هلیکوباکترپیلوری نسبت به آنتی بیوتیک‌های رایج است ویکی ازآن ها گیاه بومادران می‌باشد که ترکیبات آن سبب ازبین بردن هلیکوباکترپیلوری می‌شود همچنین مطالعات تجربی نشان داد که آنزیم اوره‌آز این باکتری سبب حیات آن در معده می‌شود پس این فرض به وجود آمد که ترکیبات گیاه بومادران ممکن است بر روی آنزیم اوره آز تآثیر داشته باشند مبحث طراحی دارویی گیاهی برای مقابله با هلیکوباکترپیلوری می باشد که با استفاده از شبیه سازی داکینگ مولکولی ونرم افزار اتوداک۴ انجام شد آلفاپنین با انرژی آزاد اتصال(5/15-) وکاریوفلین اکسید با انرژی آزاد اتصال(5/43-) وبیسموت با انرژی آزاد اتصال(4/92-) برای مهار آنزیم اوره آز می توانند استفاده شوند. کاریوفلین اکسید با انرژی اتصال بالامهارکننده بهتری برای آنزیم است. کلمات کلیدی: هلیکوباکتر پیلوری، آنزیم اوره آز، داکینگ ملکولی، آلفاپنین، کاریوفلین اکسید  Manuscript profile

هلیکوباکتر پیلوری یک باکتری میکروآئروفیل و مارپیچی شکل است که در مخاط معده ساکن است و عامل عمده زخم و ورم معده است. به‌تازگی اثر چند دارو ازجمله داروی نیزاتیدین در مهار فعالیت FRD در هلیکوباکتر پیلوری نشان داده ‌شده است که رشد سلولی را متوقف می‌کند و منجر به مرگ سلول می‌شود هدف از این مطالعه، مقایسه و ارزیابی اثرات ضد باکتریایی تعدادی از ترکیبات گیاه بومادران بر روی آنزیمFRD با استفاده از داکینگ مولکولی و شبیه‌سازی دینامیک مولکولی بود. ساختار سه‌بعدی تعدادی از ترکیبات بومادران با نرم‌افزارگاوسین کشیده و بهینه شده و نحوه‌ی اتصال این ترکیبات (انرژی اتصال) به آنزیم FRD پس از مدل‌سازی ساختار سه بعدی آنزیم با نرم‌افزار مدلر (Modeller10.14) بررسی شد و برای ارزیابی و مقایسه ی نتایج اتصال ترکیبات بومادران روی آنزیم FRD از داروی نیزاتیدین که اثر آن روی FRDثابت ‌شده است در مطالعات داکینگ استفاده شد و سپس از بین ترکیبات بومادران، سه ترکیب که بالاترین انرژی اتصال داشتند برای شبیه‌سازی دینامیک مولکولی بر روی آنزیم FRD انتخاب شدند. شبیه‌سازی دینامیک ملکولی با استفاده از کمپلکس با بهترین حالت اتصال به‌دست ‌آمده از داکینگ انجام گرفت بعد از ۱۰ نانوثانیه شبیه سازی محاسبات جذرمیانگین مربعات جابجایی (RMSD) اسکلت اصلی آنزیم FRD نشان داد که درکل شبیه‌سازی‌ها تقریباً مشابه و یکنواخت می‌باشد که نشان می‌دهد آنزیم درطی شبیه‌سازی پایداربوده است؛ ومحاسبه ی فاصله ی مرکزجرم نیز بیان داشت که ترکیب تیمول کم‌ترین فاصله را باآنزیم از بین سه ترکیب دارد وبهترین تأثیر را می‌گذارد. Manuscript profile

جذب و فعالیت آنتی اکسیدانتی گالیک اسید روی سطح فولرن B12N12 با کمک نظریه تابعیت چگالی(DFT) در روشهای B3PW91-D و M06-2X-D بررسی شده است. مقادیر انرژی جذب و خصوصیات الکترونی نشان داد که این مولکول به سطح فولرن B12N12 جذب شیمیایی شده است و تغییرات قابل توجهی در خواص الکترونیکی فولرن ایجاد گردید. فعالیتهای آنتی اکسیدانی مولکول گالیک اسید و کمپلکس B12N12/Gal با استفاده از سطح تئوری M06-2X-D بر اساس انتقال اتم هیدروژن (HAT)، انتقال الکترون منفرد و پس از آن انتقال پروتون (SET-PT) و روش SPLET بررسی شده است. برای درک بهتر خواص آنتی اکسیدانی، مقادیر آنتالپی تفکیک پیوند (BDE)، پتانسیل یونیزاسیون (IP)، آنتالپی تفکیک پروتون (PDE)، پروتون خواهی (PA) و آنتالپی انتقال الکترون (ETE) گالیک اسید روی سطح فولرن B12N12 در فاز گاز، بنزن، اتانول و آب محاسبه شده است. نتایج نشان داد که فولرن B12N12 باعث افزایش فعالیت آنتی اکسیدانتی گالیک اسید شده است. همچنین نتایج داکینگ نشان داد که انرژی واندروالس بیشترین سهم رادراین برهمکنش داشته وثابت مهارکنندگی نیز نشان دهنده افزایش قدرت فعالیت ضد رادیکالی گالیک اسید دراثر برهمکنش با فولرن بور-نیترید می باشد Manuscript profile